Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Khdc3Q9CWU5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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