Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx28Q9CWT6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ddx28Q9CWT6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ddx28Q9CWT6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ddx28Q9CWT6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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