Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pard3bQ9CSB4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pard3bQ9CSB4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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