Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdm1Q9CQK3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms