Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmed6Q9CQG0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms