Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ergic3Q9CQE7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ergic3Q9CQE7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ergic3Q9CQE7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ergic3Q9CQE7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ergic3Q9CQE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ergic3Q9CQE7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms