Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms