Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RetnQ99P87 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms