Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sf3b1Q99NB9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sf3b1Q99NB9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sf3b1Q99NB9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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