Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac9Q99N13 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdac9Q99N13 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms