Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rcbtb2Q99LJ7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms