Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Vmp1Q99KU0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmp1Q99KU0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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