Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp11Q99K46 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms