Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd6Q99JI4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms