Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ddb2Q99J79 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ddb2Q99J79 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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