Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec3Q99J72 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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