Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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