Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spdl1Q923A2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms