Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms