Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col26a1Q91VF6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms