Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q8VDP2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms