Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Dnajc28Q8VCE1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnajc28Q8VCE1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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