Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmn1r200Q8R281 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms