Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CipcQ8R0W1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CipcQ8R0W1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms