Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud6bQ8K2H2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud6bQ8K2H2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud6bQ8K2H2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud6bQ8K2H2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud6bQ8K2H2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms