Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcf3Q8K268 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Abcf3Q8K268 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Abcf3Q8K268 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Abcf3Q8K268 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Abcf3Q8K268 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Abcf3Q8K268 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Abcf3Q8K268 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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