Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms