Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LgsnQ8CIX8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms