Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms