Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh13Q8CEE7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms