Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nsun3Q8CCT7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nsun3Q8CCT7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms