Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc113Q8C5T8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms