Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne1Q8C166 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cpne1Q8C166 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms