Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Triml1Q8BVP1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Triml1Q8BVP1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms