Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdcl3Q8BVF2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdcl3Q8BVF2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdcl3Q8BVF2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms