Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmod1Q8BVA4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmod1Q8BVA4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms