Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grik4Q8BMF5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik4Q8BMF5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms