Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp1Q8BJQ2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms