Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tm2d3Q8BJ83 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms