Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg4bQ8BGE6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg4bQ8BGE6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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