Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Liat1Q810M6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Liat1Q810M6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms