Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc28Q80XJ3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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