Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms