Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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