Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Shq1Q7TMX5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Shq1Q7TMX5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Shq1Q7TMX5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Shq1Q7TMX5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Shq1Q7TMX5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Shq1Q7TMX5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms