Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ubfd1Q78JW9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubfd1Q78JW9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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