Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed3Q78IS1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms