Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Higd1cQ76I25 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms