Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynmQ70IV5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynmQ70IV5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms