Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms